Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB9BQ9NP90 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms