Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms