Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NRDE2Q9H7Z3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NRDE2Q9H7Z3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms