Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms