Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLMPQ9H6B4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms