Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIL1Q9H173 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms