Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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