Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC90BQ9GZT6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms