Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms