Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BCO2Q9BYV7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms