Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP1-5Q9BYS1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP1-5Q9BYS1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms