Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCAPERQ9BY12 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCAPERQ9BY12 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms