Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSBP4Q9BWG4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SSBP4Q9BWG4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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