Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PHF23Q9BUL5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHF23Q9BUL5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms