Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERPUD2Q9BSE4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms