Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCK3Q9BQ16 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCK3Q9BQ16 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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