Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3R4Q99570 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3R4Q99570 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3R4Q99570 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms