Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms