Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms