Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX18Q96RF0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms