Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms