Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC138Q96M89 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms