Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC7Q96M83 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms