Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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SAMD8Q96LT4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SAMD8Q96LT4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SAMD8Q96LT4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SAMD8Q96LT4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SAMD8Q96LT4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD8Q96LT4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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