Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM71F1Q96KD3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms