Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDLIM2Q96JY6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms