Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC136Q96JN2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC136Q96JN2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms