Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VPS50Q96JG6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms