Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP4CQ96CF2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4CQ96CF2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms