Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms