Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF34Q969K3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms