Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNOT9Q92600 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms