Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBXN4Q92575 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms