Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF4Q8WV16 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCAF4Q8WV16 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms