Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3RF3Q8TEJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3RF3Q8TEJ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3RF3Q8TEJ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3RF3Q8TEJ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms