Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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CNNM3Q8NE01 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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