Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND90

PNMA1, Paraneoplastic antigen Ma1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA1Q8ND90 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA1Q8ND90 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA1Q8ND90 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms