Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARRDC4Q8NCT1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARRDC4Q8NCT1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms