Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC63Q8NA47 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC63Q8NA47 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms