Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC155Q8N6L0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms