Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf62Q8N4C0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf62Q8N4C0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms