Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP4Q8N3C7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLIP4Q8N3C7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms