Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37DQ86XT2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37DQ86XT2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms