Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms