Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC29A4Q7RTT9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms