Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYDE1Q6ZW31 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms