Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf139Q6ZV77 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms