Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST4

LCNL1, Lipocalin-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCNL1Q6ZST4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCNL1Q6ZST4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms