Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC73Q6ZRK6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms