Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms